教学楼

南科大校内主要有校前区（图书馆、湖畔食堂一带）教学区和荔园教学区两大教学区。

校前区教学区

本区内有第一教学楼、第二教学楼两栋教学楼，此外某些譬如物理系开设的“凝聚态物理学讲坛”、创新创业学院开设的“创新创业大讲堂”等讲座性质的课程会在图书馆报告厅、第一科研楼报告厅等地上课。

第一教学楼

主教学楼，分为南、北两部分，分别为教学实验室区域和多媒体教室区域。

第二教学楼

次教学楼，有两层半，以机房为主，计算机系课程的实验课部分安排于此。一楼南侧为新成立的慕课中心，二楼南侧为艺术中心教室。（此部分待完善）

荔园教学区

荔园一栋、二栋、六栋为教学楼。

荔园一栋

一二楼为多媒体教室，三楼及以上为教学实验室。

荔园二栋

一至三楼为多媒体教室，其中Hey Studio工作室也位于三楼。四楼及以上为教学实验室。

荔园六栋

一二楼为食堂，以上楼层有机房，计算机系课程实验课也有一部分在此上课。